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解码日本牵牛花的基因组

发布时间:2019-03-20 12:50 来源:未知 编辑:admin

  日本的研究人员成功解码了整个日本牵牛花基因组。日本牵牛花(Ipomoea nil)是日本流行的传统园林植物。夏天,您可以在许多日本花园中看到这朵花。此外,已知突变体由于称为转座子的“跳跃基因”的作用而经常出现在牵牛花中。从江户时代(约200年前)开始,已经培育和欣赏了具有异形花朵和叶子的牵牛花,这已经发展成为日本独特的园艺文化。由于这些“突变体牵牛花”的流行,已经收集了许多天然突变体。在现代,通过详细分析这些突变体,

  该研究小组破译了日本牵牛花标准线的整个基因组。其中一位研究负责人,Keio大学的Yasubumi Sakakibara教授负责本研究中的基因组装配和生物信息学分析,他说“ 获得了高质量的几乎完整的基因组序列,从而确定了编码序列大约四万三千个牵牛花基因,以及产生各种牵牛花颜色和形状的转座子的数量和分布。“

  研究小组使用整个基因组序列来表征突变体,这些突变体显示出具有深绿色,厚实和皱纹叶子的侏儒症。他们确定了植物激素生物合成的基因,该基因被突变体中的转座子破坏。

  九州大学讲师,国家生物资源项目(NBRP)牵牛花的股票经理Eiji Nitasaka说:“随着基因组的解码,使用日本牵牛花作为模式生物的价值急剧增加。我希望日本的牵牛花及其突变体将被世界各地的许多研究人员使用。“ 这项研究的领导者之一,国立基础生物学研究所助理教授Atsushi Hoshino说:“ 日本牵牛花的基因组序列不仅有助于理解牵牛花本身,还将用于研究与甘薯等密切相关的作物。“ 该研究发表在Nature Communications上。

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